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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

“一带一路”互联网国际合作论坛：推动建设数字丝绸之路******

　　【分论坛焦点】

　　光明日报乌镇11月9日电（记者张晓华、王禹欣）11月9日下午，世界互联网大会乌镇峰会“一带一路”互联网国际合作论坛在乌镇互联网国际会议中心召开。论坛着眼探索如何在世界百年变局和世纪疫情叠加形势下，推动“一带一路”沿线国家数字经济领域的全球交流合作，高质量建设数字丝绸之路。

　　古巴通信部部长阿雷维奇以视频形式发表致辞。她表示，为了促进建立一个在网络空间拥有共同未来的社区，古巴提倡将国家联合合作作为网络安全领域国际关系的基本原则。

　　埃及高等教育部副部长希沙姆·法鲁克在视频致辞中表示，对中国企业参与基础设施等核心领域的建设表示欢迎。“我们愿意积极主动与中方开展合作，将中国企业、研究实验室和智慧城市等领域的专业知识和技术引进埃及。”

　　“互联网彻底改变了我们的通信，我们实现了实时合作与竞争。”巴基斯坦驻华大使莫因·哈克在视频致辞中表示，所有国家在互联网发展过程中均享有参与建立互联网监管模式、制定公共互联网政策、平等参与全球网络空间治理的权利，建立数字包容共同体是世界各国共有的责任。

　　“北斗导航系统正在为‘一带一路’数字经济发展作出贡献。”中国卫星导航系统管理办公室主任冉承其说，北斗系统规模应用已经进入市场化、产业化、国际化发展的新阶段，必将伴随全球数字经济快速发展而发挥更加突出的作用，为构建人类命运共同体作出更大贡献。

　　《光明日报》（ 2022年11月10日 11版）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）